16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5697 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5697  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  266  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4042  hypothetical protein  35.82 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3393  hypothetical protein  36.15 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.000000765779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2088  hypothetical protein  34.33 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0170245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3157  hypothetical protein  40.57 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1352  hypothetical protein  33.87 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0255  hypothetical protein  30.16 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1264  hypothetical protein  39.42 
 
 		 274 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2411  hypothetical protein  31.45 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1314  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.550477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2086  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2738  hypothetical protein  37.8 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1875  hypothetical protein  35.78 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0375  hypothetical protein  30.25 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1003  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3436  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>