15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1352 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1352  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2088  hypothetical protein  61.36 
 
 
132 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0170245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4042  hypothetical protein  62.12 
 
 
132 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3393  hypothetical protein  59.09 
 
 
132 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.000000765779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3436  hypothetical protein  40.95 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3157  hypothetical protein  36.54 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5697  hypothetical protein  33.87 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1264  hypothetical protein  35.64 
 
 
274 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1314  hypothetical protein  35.64 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.550477  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2086  hypothetical protein  35.64 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0631  hypothetical protein  31.45 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322308  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2411  hypothetical protein  30.37 
 
 
138 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974908  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0375  hypothetical protein  31.15 
 
 
123 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1003  hypothetical protein  31.15 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2991  hypothetical protein  29.03 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>