15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2088 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0170245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4042  hypothetical protein  95.45 
 
 		 132 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3393  hypothetical protein  79.55 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.000000765779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1352  hypothetical protein  61.36 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3157  hypothetical protein  36.54 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5697  hypothetical protein  34.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3436  hypothetical protein  39.78 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1314  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.550477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2086  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1264  hypothetical protein  31 
 
 		 274 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0631  hypothetical protein  29.75 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1642  hypothetical protein  39.66 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1875  hypothetical protein  42.31 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1316  hypothetical protein  28.72 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2411  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>