17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3393 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3393  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.000000765779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4042  hypothetical protein  79.55 
 
 		 132 aa  226  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2088  hypothetical protein  79.55 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0170245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1352  hypothetical protein  59.09 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.550477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1264  hypothetical protein  32.2 
 
 		 274 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3157  hypothetical protein  31.82 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5697  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0631  hypothetical protein  34.11 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3436  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0375  hypothetical protein  31.15 
 
 		 123 aa  43.9  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1003  hypothetical protein  31.15 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2991  hypothetical protein  29.47 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1875  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2411  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1642  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>