18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0689 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0689  transport-associated  100 
 
 		 170 aa  323  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2102  hypothetical protein  86.98 
 
 		 193 aa  246  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0778  transport-associated  86.98 
 
 		 193 aa  246  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  35.9 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  41.27 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  42.37 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5136  hypothetical protein  40.35 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  42.37 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  41.82 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  33.04 
 
 		 301 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  35.94 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  32.18 
 
 		 166 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  32.58 
 
 		 150 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  32.58 
 
 		 150 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  34.92 
 
 		 119 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  33.87 
 
 		 412 aa  40.8  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  36.92 
 
 		 103 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.73 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>