18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3283 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3283  phasin  100 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0155  phasin family protein  40.77 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5043  hypothetical protein  34.06 
 
 		 218 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3730  phasin  32.28 
 
 		 141 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4401  phasin family protein  30.53 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0720  phasin  30.47 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98337  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4487  phasin family protein  28.46 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0287757  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4685  phasin family protein  28.57 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.407769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1391  phasin  25.56 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.216512  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  27.78 
 
 		 180 aa  43.9  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 301 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  28.43 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  28.57 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  28.57 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  28.57 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  28.57 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  28.57 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  26.13 
 
 		 192 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>