10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4401 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4401  phasin family protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0720  phasin  97.86 
 
 
140 aa  274  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98337  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4487  phasin family protein  71.22 
 
 
139 aa  204  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0287757  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1391  phasin  54.68 
 
 
171 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.216512  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3730  phasin  47.73 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5043  hypothetical protein  45.52 
 
 
218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2137  hypothetical protein  36.59 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0900409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4685  phasin family protein  32.17 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.407769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3283  phasin  30.53 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0155  phasin family protein  29.2 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>