10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5043 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5043  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3730  phasin  63.77 
 
 		 141 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0720  phasin  46.27 
 
 		 140 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98337  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4487  phasin family protein  48.51 
 
 		 139 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0287757  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4401  phasin family protein  45.52 
 
 		 141 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1391  phasin  48.89 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.216512  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3283  phasin  34.06 
 
 		 158 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0155  phasin family protein  32.35 
 
 		 157 aa  89.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4685  phasin family protein  33.59 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.407769  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2137  hypothetical protein  32.54 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0900409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>