10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4487 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4487  phasin family protein  100 
 
 
139 aa  276  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0287757  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0720  phasin  72.66 
 
 
140 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98337  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4401  phasin family protein  71.22 
 
 
141 aa  204  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1391  phasin  60.58 
 
 
171 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.216512  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3730  phasin  51.11 
 
 
141 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5043  hypothetical protein  48.51 
 
 
218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2137  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0900409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0155  phasin family protein  32.62 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4685  phasin family protein  33.33 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.407769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3283  phasin  28.46 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>