11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0155 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0155  phasin family protein  100 
 
 		 157 aa  319  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3283  phasin  40.77 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3730  phasin  35.82 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5043  hypothetical protein  32.35 
 
 		 218 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4487  phasin family protein  32.62 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0287757  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4401  phasin family protein  29.2 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0720  phasin  28.68 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98337  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1391  phasin  33.8 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.216512  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0504  phasin  25.74 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0499  phasin  22.55 
 
 		 288 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  23.76 
 
 		 299 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>