10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0720 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0720  phasin  100 
 
 		 140 aa  279  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98337  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4401  phasin family protein  97.86 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4487  phasin family protein  72.66 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0287757  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1391  phasin  54.74 
 
 		 171 aa  140  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.216512  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3730  phasin  47.76 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5043  hypothetical protein  46.27 
 
 		 218 aa  126  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4685  phasin family protein  33.57 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.407769  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2137  hypothetical protein  36.59 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0900409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3283  phasin  30.47 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0155  phasin family protein  28.68 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>