More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2187 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2187  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
445 aa  916    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
451 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
451 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4863  Serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
534 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00126679  unclonable  0.000000230163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0528  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
550 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.57 
 
 
1856 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2506  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000826348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
870 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1554  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
531 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0554404  normal  0.189627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2439  serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
562 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  32 
 
 
716 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
641 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5178  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
607 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  30 
 
 
654 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54265  calcium/calmodulin-dependent protein kinase  30.39 
 
 
325 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1709  serine/threonine protein kinase  40.96 
 
 
596 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.88 
 
 
757 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2139  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.96 
 
 
594 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.639264  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2229  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.96 
 
 
596 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.58 
 
 
666 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
517 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0059  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
514 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1363  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
478 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.874893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 
519 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
455 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.07 
 
 
587 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 
503 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
696 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
534 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 
602 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33 
 
 
569 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4862  Serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
508 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403484  unclonable  0.000000197931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.32 
 
 
642 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  26.43 
 
 
637 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
563 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
542 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41102  predicted protein  28.95 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367814  normal  0.0442163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  26.4 
 
 
494 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4214  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
492 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655548  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  27.5 
 
 
641 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.2 
 
 
551 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.35 
 
 
618 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4175  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
492 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
617 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
576 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  31.03 
 
 
576 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.73 
 
 
438 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2879  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.23 
 
 
224 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  39.76 
 
 
634 aa  60.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
619 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2457  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 
512 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.32 
 
 
446 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1553  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
760 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3967  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
533 aa  60.5  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
623 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
416 aa  60.1  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5792  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766512  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2237  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
512 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
535 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
776 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 
971 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
666 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
450 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
673 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 
653 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 
718 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
487 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2291  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
512 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.76151  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0256  serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 
513 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.457205  normal  0.272981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6424  serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 
1280 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.328261  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2648  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
578 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0958386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0099  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
581 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
646 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  30.48 
 
 
993 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  29.61 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2626  hypothetical protein  37.86 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
539 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
525 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1709  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.366851  normal  0.0986439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
898 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5051  predicted protein  37.5 
 
 
261 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00251511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
763 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.68 
 
 
1262 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 
604 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.14 
 
 
520 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.66 
 
 
557 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34071  predicted protein  26.56 
 
 
355 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  28.57 
 
 
476 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
468 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>