60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4738 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4738  flagellar transcriptional activator FlhC  100 
 
 		 185 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2469  transcriptional activator FlhC  30.06 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000243511  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1749  flagellar transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0010889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2870  transcriptional activator FlhC  26.79 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1987  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.76515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2124  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1741  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0165294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1293  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169598  decreased coverage  0.00000000643464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2630  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574971  hitchhiker  0.00000000000000252047 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1509  transcriptional activator FlhC  27.49 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01851  hypothetical protein  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01862  DNA-binding transcriptional dual regulator with FlhD  29.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1320  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000170782  decreased coverage  3.16651e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1197  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000725096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2080  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000348809  decreased coverage  0.000000427944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2140  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000606763  unclonable  4.37238e-33 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2085  transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  unclonable  1.9119800000000002e-30 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1746  transcriptional activator FlhC  29.73 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0285133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2828  transcriptional activator FlhC  29.73 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.896051  normal  0.0881752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1635  transcriptional activator FlhC  29.73 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2614  transcriptional activator FlhC  28.67 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00253226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1852  transcriptional activator FlhC  27.5 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00303286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3228  transcriptional activator FlhC  28.33 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2988  transcriptional activator FlhC  26.16 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.996074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1537  transcriptional activator FlhC  26.29 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00505633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1004  transcriptional activator FlhC  27.1 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0152  transcriptional activator FlhC  27.1 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2372  transcriptional activator FlhC  29.41 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0161  transcriptional activator FlhC  27.71 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0165  transcriptional activator FlhC  27.11 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0115  transcriptional activator FlhC  28.22 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0178  transcriptional activator FlhC  27.11 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3354  transcriptional activator FlhC  27.11 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3186  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24310  transcriptional activator FlhC  26.47 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4210  transcriptional activator FlhC  26.21 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4543  transcriptional activator FlhC  28.29 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3686  transcriptional activator FlhC  27.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3859  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3439  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1691  transcriptional activator FlhC  24.84 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1680  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0081  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3940  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3112  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2863  transcriptional activator FlhC  26.25 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0234  transcriptional activator FlhC  27.11 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2027  transcriptional activator FlhC  25 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000461125  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0857  transcriptional activator FlhC  28.29 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563852  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2885  transcriptional activator FlhC  28.76 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.217892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4638  transcriptional activator FlhC  28.95 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0578695  normal  0.560495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5605  transcriptional activator FlhC  28.75 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.31133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2978  transcriptional activator FlhC  27.5 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000050708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3819  transcriptional activator FlhC  27.44 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7082  transcriptional activator FlhC  29.63 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2855  transcriptional activator FlhC  25.45 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0252  transcriptional activator FlhC  25.45 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260782  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1859  transcriptional activator FlhC  27.06 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2005  transcriptional activator FlhC  25.77 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0232407  hitchhiker  0.00239216 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1412  transcriptional activator FlhC  25.17 
 
 		 186 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.567271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>