38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3584 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3584  DGC domain protein  100 
 
 		 141 aa  276  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4661  DGC domain protein  100 
 
 		 141 aa  276  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02298  putative lipoprotein  80.43 
 
 		 139 aa  216  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.403801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1786  DGC domain protein  85.04 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0157981  normal  0.765204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2110  DGC domain protein  85.04 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5009  putative lipoprotein  68.1 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4921  hypothetical protein  63.25 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2528  DGC domain protein  53.6 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0653  DGC domain protein  63.11 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1228  hypothetical protein  67 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13720  hypothetical protein  66 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.771315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2576  DGC domain protein  60.75 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3223  hypothetical protein  60.75 
 
 		 132 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1701  hypothetical protein  61.05 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.761262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2746  hypothetical protein  61.05 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2901  hypothetical protein  61.05 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2689  hypothetical protein  61.05 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2386  hypothetical protein  61.05 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2811  hypothetical protein  61.05 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1933  hypothetical protein  61.54 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0595267  normal  0.493015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1807  hypothetical protein  55.45 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2012  DGC domain protein  51.96 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.346837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3654  hypothetical protein  46.73 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3599  hypothetical protein  36.28 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0942  hypothetical protein  30.91 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0154  hypothetical protein  32.65 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0555  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00628557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0690  hypothetical protein  34.69 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.535848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0528416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2568  DGC domain protein  32.95 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1213  hypothetical protein  27.42 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0859  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.382834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0458  DGC domain protein  25.47 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.879309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0139  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1326  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000406001  decreased coverage  0.00385616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0553  hypothetical protein  25.66 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365855  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0814  hypothetical protein  26.85 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.375979  normal  0.817572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>