33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0139 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0139  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2569  DGC domain protein  41.35 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0858  hypothetical protein  33.94 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0813  hypothetical protein  45.07 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.658208  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0859  hypothetical protein  36.04 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.382834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0690  hypothetical protein  33.64 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.535848  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1326  hypothetical protein  33.03 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000406001  decreased coverage  0.00385616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0154  hypothetical protein  32.43 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1213  hypothetical protein  29.75 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1711  hypothetical protein  33.67 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0528416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3599  hypothetical protein  28.44 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0555  hypothetical protein  29.2 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00628557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2568  DGC domain protein  30.47 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0942  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3584  DGC domain protein  32.74 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4661  DGC domain protein  32.74 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2528  DGC domain protein  27.78 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3654  hypothetical protein  29.59 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2689  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2746  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1701  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.761262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2901  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2386  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1807  hypothetical protein  28.85 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2811  hypothetical protein  29.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02298  putative lipoprotein  32.76 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.403801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0553  hypothetical protein  26.96 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0653  DGC domain protein  26.45 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2110  DGC domain protein  34.29 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1786  DGC domain protein  34.29 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0157981  normal  0.765204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5009  putative lipoprotein  33.68 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0814  hypothetical protein  29.84 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.375979  normal  0.817572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>