50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0020 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  559  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0023  hypothetical protein  55.56 
 
 		 130 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0859  hypothetical protein  48.48 
 
 		 151 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.382834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0814  hypothetical protein  43.87 
 
 		 149 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.375979  normal  0.817572 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0690  hypothetical protein  43.64 
 
 		 122 aa  98.6  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.535848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2568  DGC domain protein  45.87 
 
 		 150 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0154  hypothetical protein  37.9 
 
 		 127 aa  95.5  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1326  hypothetical protein  38.05 
 
 		 139 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000406001  decreased coverage  0.00385616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3599  hypothetical protein  44.55 
 
 		 125 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1711  hypothetical protein  40.2 
 
 		 127 aa  89  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0528416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0942  hypothetical protein  36.52 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0812  hypothetical protein  39.68 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.998048  normal  0.489528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0555  hypothetical protein  39.39 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00628557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0458  DGC domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.879309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  39.34 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2901  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1701  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.761262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2746  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2689  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2386  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2811  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1807  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2576  DGC domain protein  28.85 
 
 		 132 aa  72  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3223  hypothetical protein  28.85 
 
 		 132 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2528  DGC domain protein  30.39 
 
 		 132 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2012  DGC domain protein  30.1 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.346837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0553  hypothetical protein  38.39 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0653  DGC domain protein  26.42 
 
 		 136 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1228  hypothetical protein  25.24 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13720  hypothetical protein  24.27 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.771315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1933  hypothetical protein  29.13 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0595267  normal  0.493015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1646  hypothetical protein  36.43 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1213  hypothetical protein  28.45 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3654  hypothetical protein  28.87 
 
 		 138 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5009  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4921  hypothetical protein  28.41 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4048  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4661  DGC domain protein  26.4 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3584  DGC domain protein  26.4 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02298  putative lipoprotein  27.2 
 
 		 139 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.403801 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5667  hypothetical protein  35.07 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0445174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2110  DGC domain protein  25 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1786  DGC domain protein  25 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0157981  normal  0.765204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4029  hypothetical protein  31.78 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0813  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.658208  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0139  hypothetical protein  33.03 
 
 		 137 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0858  hypothetical protein  32.41 
 
 		 118 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 372 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0076  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.375945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2569  DGC domain protein  26.67 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>