37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5009 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5009  putative lipoprotein  100 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4921  hypothetical protein  76.42 
 
 
134 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970843 
 
 
-
 
NC_003296  RS02298  putative lipoprotein  66.67 
 
 
139 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.403801 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3584  DGC domain protein  68.1 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4661  DGC domain protein  68.1 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1786  DGC domain protein  74.26 
 
 
129 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0157981  normal  0.765204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2110  DGC domain protein  74.26 
 
 
129 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227478  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0653  DGC domain protein  58.47 
 
 
136 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3223  hypothetical protein  58.41 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2576  DGC domain protein  58.41 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13720  hypothetical protein  67.96 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.771315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1228  hypothetical protein  58.77 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2528  DGC domain protein  55.83 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1701  hypothetical protein  61.39 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.761262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2746  hypothetical protein  61.39 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2689  hypothetical protein  61.39 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2901  hypothetical protein  61.39 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2386  hypothetical protein  61.39 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2811  hypothetical protein  61.39 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1807  hypothetical protein  61.39 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1933  hypothetical protein  61.76 
 
 
124 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0595267  normal  0.493015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2012  DGC domain protein  55.32 
 
 
126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.346837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3654  hypothetical protein  42.48 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0942  hypothetical protein  32.73 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2568  DGC domain protein  33.33 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0555  hypothetical protein  30.36 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00628557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3599  hypothetical protein  33.93 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0154  hypothetical protein  29.36 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1711  hypothetical protein  29.36 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0528416  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0690  hypothetical protein  30.28 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.535848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  28.41 
 
 
284 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0458  DGC domain protein  27.55 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.879309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0859  hypothetical protein  29.21 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.382834  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0814  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.375979  normal  0.817572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0553  hypothetical protein  23.48 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1213  hypothetical protein  25.3 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0139  hypothetical protein  33.68 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>