39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2746 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2746  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  296  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2811  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  296  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1701  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  293  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.761262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2689  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  293  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2901  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  293  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2386  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  293  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1807  hypothetical protein  89.33 
 
 
150 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2576  DGC domain protein  70 
 
 
132 aa  163  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3223  hypothetical protein  70 
 
 
132 aa  163  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0653  DGC domain protein  60.68 
 
 
136 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1228  hypothetical protein  65.09 
 
 
131 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2528  DGC domain protein  57.26 
 
 
132 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13720  hypothetical protein  64.15 
 
 
131 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.771315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2012  DGC domain protein  52 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.346837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1786  DGC domain protein  57.55 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0157981  normal  0.765204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2110  DGC domain protein  57.55 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227478  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4921  hypothetical protein  54.4 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1933  hypothetical protein  52.99 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0595267  normal  0.493015 
 
 
-
 
NC_003296  RS02298  putative lipoprotein  62.11 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.403801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5009  putative lipoprotein  61.39 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3584  DGC domain protein  61.05 
 
 
141 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4661  DGC domain protein  61.05 
 
 
141 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3654  hypothetical protein  48.04 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0942  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0154  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1711  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0528416  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2568  DGC domain protein  39.33 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0555  hypothetical protein  42.7 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00628557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  31.2 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3599  hypothetical protein  36.11 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0690  hypothetical protein  40.23 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.535848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0458  DGC domain protein  32.11 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.879309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1213  hypothetical protein  29.81 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0859  hypothetical protein  31.46 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.382834  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0553  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0858  hypothetical protein  32.61 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412503  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1326  hypothetical protein  25.23 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000406001  decreased coverage  0.00385616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0139  hypothetical protein  29.52 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0814  hypothetical protein  23.08 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.375979  normal  0.817572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>