41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0690 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0690  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  243  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.535848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2568  DGC domain protein  46.67 
 
 
150 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  43.64 
 
 
284 aa  99.4  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0154  hypothetical protein  42.02 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0942  hypothetical protein  39.82 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1711  hypothetical protein  47 
 
 
127 aa  90.5  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0528416  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3599  hypothetical protein  40.57 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0555  hypothetical protein  39.47 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00628557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0859  hypothetical protein  36.21 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.382834  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1213  hypothetical protein  35.45 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1326  hypothetical protein  32.71 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000406001  decreased coverage  0.00385616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0814  hypothetical protein  33.03 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.375979  normal  0.817572 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2689  hypothetical protein  40.23 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2811  hypothetical protein  40.23 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2746  hypothetical protein  40.23 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1701  hypothetical protein  40.23 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.761262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2901  hypothetical protein  40.23 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2386  hypothetical protein  40.23 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1807  hypothetical protein  34.31 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2110  DGC domain protein  33.67 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227478  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3223  hypothetical protein  35.35 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1786  DGC domain protein  33.67 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0157981  normal  0.765204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0653  DGC domain protein  33.01 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0553  hypothetical protein  35.45 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365855  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2576  DGC domain protein  34.34 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3584  DGC domain protein  34.69 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4661  DGC domain protein  34.69 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1933  hypothetical protein  29.09 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0595267  normal  0.493015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4921  hypothetical protein  33.96 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2012  DGC domain protein  29.25 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.346837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0458  DGC domain protein  33.02 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.879309  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2528  DGC domain protein  31.96 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5009  putative lipoprotein  30.28 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3654  hypothetical protein  32.46 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02298  putative lipoprotein  28.04 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.403801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0139  hypothetical protein  33.64 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1228  hypothetical protein  32.18 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13720  hypothetical protein  32.18 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.771315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0858  hypothetical protein  30.63 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.412503  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2569  DGC domain protein  26.92 
 
 
111 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0813  hypothetical protein  37.29 
 
 
78 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.658208  normal  0.609574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>