38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02298 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02298  putative lipoprotein  100 
 
 		 139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.403801 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3584  DGC domain protein  80.43 
 
 		 141 aa  216  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4661  DGC domain protein  80.43 
 
 		 141 aa  216  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1786  DGC domain protein  83.59 
 
 		 129 aa  196  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0157981  normal  0.765204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2110  DGC domain protein  83.59 
 
 		 129 aa  196  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5009  putative lipoprotein  66.67 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4921  hypothetical protein  63.79 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2528  DGC domain protein  54.47 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0653  DGC domain protein  53.79 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1228  hypothetical protein  68.75 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13720  hypothetical protein  67.01 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.771315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1807  hypothetical protein  59 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2746  hypothetical protein  62.11 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2689  hypothetical protein  62.11 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1701  hypothetical protein  62.11 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.761262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2901  hypothetical protein  62.11 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2386  hypothetical protein  62.11 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3223  hypothetical protein  64.89 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2811  hypothetical protein  62.11 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2576  DGC domain protein  64.89 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1933  hypothetical protein  57.76 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0595267  normal  0.493015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2012  DGC domain protein  54.46 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.346837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3654  hypothetical protein  43.86 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.556291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0154  hypothetical protein  31.53 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3599  hypothetical protein  35.4 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0942  hypothetical protein  28.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0555  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00628557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2568  DGC domain protein  32.65 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0528416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0690  hypothetical protein  28.04 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.535848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0458  DGC domain protein  26.09 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.879309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1213  hypothetical protein  27.97 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0859  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.382834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  27.1 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0139  hypothetical protein  32.76 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0553  hypothetical protein  27.62 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1326  hypothetical protein  23.23 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000406001  decreased coverage  0.00385616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0814  hypothetical protein  27.88 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.375979  normal  0.817572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>