34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5115 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5115  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1059  hypothetical protein  70.82 
 
 		 284 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0955  hypothetical protein  66.9 
 
 		 281 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5936  hypothetical protein  62.17 
 
 		 272 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0125  hypothetical protein  61.18 
 
 		 319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4477  hypothetical protein  57.2 
 
 		 284 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.321989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4316  hypothetical protein  55.06 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108143  normal  0.0233211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0282  hypothetical protein  54.96 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2077  hypothetical protein  53.52 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3647  hypothetical protein  46.59 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3532  hypothetical protein  43.56 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249729  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1926  xanthine and CO dehydrogenase maturation factor  41.57 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  35.21 
 
 		 526 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  33.46 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1695  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  32.31 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  31.48 
 
 		 541 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  31.48 
 
 		 541 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.48 
 
 		 541 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  31.48 
 
 		 541 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.48 
 
 		 541 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2002  biotin/lipoyl attachment  34.11 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000112528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  31.48 
 
 		 541 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.48 
 
 		 541 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.11 
 
 		 541 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2909  hypothetical protein  32.42 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1488  hypothetical protein  31.95 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2138  biotin/lipoyl attachment  30.74 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2210  biotin/lipoyl attachment  29.85 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000685298  normal  0.502392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0182664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0314  biotin/lipoyl attachment  28.68 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0251  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.63 
 
 		 268 aa  99  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.135771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2658  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  25.83 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0361  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  25.77 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000066699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2951  hypothetical protein  44.44 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>