35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2833 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  100 
 
 		 275 aa  540  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2138  biotin/lipoyl attachment  61.42 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2002  biotin/lipoyl attachment  56.54 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000112528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0314  biotin/lipoyl attachment  52.71 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0251  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  54.44 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.135771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  49.05 
 
 		 541 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  49.05 
 
 		 541 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  49.05 
 
 		 541 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  49.05 
 
 		 541 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  49.05 
 
 		 541 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  48.67 
 
 		 541 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  48.67 
 
 		 541 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  49.61 
 
 		 541 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2210  biotin/lipoyl attachment  50 
 
 		 294 aa  238  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000685298  normal  0.502392 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1695  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  44.74 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2658  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  47.08 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0361  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  44.23 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000066699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1488  hypothetical protein  46.72 
 
 		 281 aa  214  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  45 
 
 		 526 aa  195  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5115  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0125  hypothetical protein  31.89 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1926  xanthine and CO dehydrogenase maturation factor  35.77 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4316  hypothetical protein  28.4 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108143  normal  0.0233211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1059  hypothetical protein  29.89 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5936  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0955  hypothetical protein  29.57 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3532  hypothetical protein  31.92 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249729  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0282  hypothetical protein  28.46 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4477  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.321989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2909  hypothetical protein  29.79 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2245  hypothetical protein  29.92 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0182664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3647  hypothetical protein  27.1 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2951  hypothetical protein  39.66 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1085  Acyl transferase  29.52 
 
 		 412 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.242324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>