34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3532 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3532  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249729  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0955  hypothetical protein  46.36 
 
 
281 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5115  hypothetical protein  43.56 
 
 
284 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4316  hypothetical protein  44.4 
 
 
290 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108143  normal  0.0233211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1059  hypothetical protein  46.67 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0125  hypothetical protein  46.33 
 
 
319 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0282  hypothetical protein  43.14 
 
 
294 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4477  hypothetical protein  44.14 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.321989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5936  hypothetical protein  42.08 
 
 
272 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2077  hypothetical protein  37.31 
 
 
287 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1695  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  30.89 
 
 
271 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1926  xanthine and CO dehydrogenase maturation factor  39.39 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0314  biotin/lipoyl attachment  32.16 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3647  hypothetical protein  37.07 
 
 
280 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2138  biotin/lipoyl attachment  34.48 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2210  biotin/lipoyl attachment  32.2 
 
 
294 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000685298  normal  0.502392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2658  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.1 
 
 
275 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2002  biotin/lipoyl attachment  32.44 
 
 
266 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000112528  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0251  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  30.27 
 
 
268 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.135771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2909  hypothetical protein  32.56 
 
 
272 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2245  hypothetical protein  34.27 
 
 
273 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0182664  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  33.08 
 
 
526 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  31.14 
 
 
541 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  31.14 
 
 
541 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.14 
 
 
541 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.14 
 
 
541 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  31.14 
 
 
541 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1488  hypothetical protein  28.85 
 
 
281 aa  99  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  31.14 
 
 
541 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.77 
 
 
541 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  30.77 
 
 
541 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  31.92 
 
 
275 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0361  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.57 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000066699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2951  hypothetical protein  39.19 
 
 
172 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>