35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0251 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0251  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.135771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0314  biotin/lipoyl attachment  56.06 
 
 		 266 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2002  biotin/lipoyl attachment  55.56 
 
 		 266 aa  289  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000112528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2210  biotin/lipoyl attachment  52.14 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000685298  normal  0.502392 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  54.65 
 
 		 541 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  54.65 
 
 		 541 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  54.65 
 
 		 541 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  54.65 
 
 		 541 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  54.65 
 
 		 541 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  54.26 
 
 		 541 aa  270  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  54.26 
 
 		 541 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  54.26 
 
 		 541 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  54.44 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2138  biotin/lipoyl attachment  50.58 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1695  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  47.88 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2658  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  47.06 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0361  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  46.59 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000066699  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  48.67 
 
 		 526 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1488  hypothetical protein  44.15 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1926  xanthine and CO dehydrogenase maturation factor  33.46 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5936  hypothetical protein  31.67 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3532  hypothetical protein  30.27 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249729  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5115  hypothetical protein  28.63 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4316  hypothetical protein  27.69 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108143  normal  0.0233211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1059  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2077  hypothetical protein  28.24 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2909  hypothetical protein  29.87 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0955  hypothetical protein  26.67 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0125  hypothetical protein  26.64 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0282  hypothetical protein  25.29 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4477  hypothetical protein  29.45 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.321989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2245  hypothetical protein  26.53 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0182664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2951  hypothetical protein  41.33 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3647  hypothetical protein  23.95 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2763  hypothetical protein  47.06 
 
 		 64 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>