33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4477 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4477  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.321989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1059  hypothetical protein  59.4 
 
 		 284 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5115  hypothetical protein  57.2 
 
 		 284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0955  hypothetical protein  54.31 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5936  hypothetical protein  52.51 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0125  hypothetical protein  51.81 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4316  hypothetical protein  46.18 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108143  normal  0.0233211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0282  hypothetical protein  48.41 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2077  hypothetical protein  44.92 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3647  hypothetical protein  44.57 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3532  hypothetical protein  44.14 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249729  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1926  xanthine and CO dehydrogenase maturation factor  38.85 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2909  hypothetical protein  31.89 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2245  hypothetical protein  32.94 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0182664  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  28.68 
 
 		 541 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  33.08 
 
 		 526 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  28.68 
 
 		 541 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.68 
 
 		 541 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.68 
 
 		 541 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  28.68 
 
 		 541 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.68 
 
 		 541 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  28.68 
 
 		 541 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.68 
 
 		 541 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.93 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2002  biotin/lipoyl attachment  27.91 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000112528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0251  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.45 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.135771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2138  biotin/lipoyl attachment  27.27 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1695  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  26.24 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0314  biotin/lipoyl attachment  25.94 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2210  biotin/lipoyl attachment  27.68 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000685298  normal  0.502392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1488  hypothetical protein  24.52 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2658  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  23.05 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0361  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  24.07 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000066699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>