28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2951 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2951  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1926  xanthine and CO dehydrogenase maturation factor  54.93 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2210  biotin/lipoyl attachment  46.67 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000685298  normal  0.502392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  50 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0251  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  41.33 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.135771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2002  biotin/lipoyl attachment  44.83 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000112528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1488  hypothetical protein  31.52 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2245  hypothetical protein  52.54 
 
 		 273 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0182664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1695  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  37.33 
 
 		 271 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0314  biotin/lipoyl attachment  38.03 
 
 		 266 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  43.84 
 
 		 526 aa  50.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2658  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  29.17 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  39.66 
 
 		 275 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2909  hypothetical protein  40.96 
 
 		 272 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0361  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  38.36 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000066699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2138  biotin/lipoyl attachment  38.67 
 
 		 268 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0125  hypothetical protein  41.51 
 
 		 319 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5115  hypothetical protein  44.44 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3532  hypothetical protein  39.19 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249729  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4316  hypothetical protein  36.51 
 
 		 290 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108143  normal  0.0233211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0955  hypothetical protein  38.89 
 
 		 281 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>