27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2934 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3007  hypothetical protein  42.34 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3814  hypothetical protein  39.82 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0232348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4881  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.06 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2467  hypothetical protein  33.64 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0625027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3647  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.64 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.14 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.136342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0593  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.18 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.879412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2566  hypothetical protein  37.23 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.48 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3709  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.48 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.81 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0798  hypothetical protein  34.55 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2484  hypothetical protein  32.08 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0333285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2298  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.19 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1820  hypothetical protein  31.07 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1083  hypothetical protein  35.56 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2131  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.24 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1846  hypothetical protein  30.1 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.98 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0705201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2284  hypothetical protein  35.82 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.797837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0354  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.48 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1647  hypothetical protein  47.83 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  23.73 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  23.73 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>