25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2653 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0705201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  61.4 
 
 
116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  37.25 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3814  hypothetical protein  40.52 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0232348  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1877  hypothetical protein  38.74 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0617  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.58 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192438  normal  0.0273387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1904  hypothetical protein  37.84 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.77 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3709  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.77 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2298  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.08 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2566  hypothetical protein  38.83 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1083  hypothetical protein  36.27 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4881  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.82 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968841  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1820  hypothetical protein  37 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0593  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.18 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.879412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3647  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.43 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2467  hypothetical protein  32.43 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0625027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1846  hypothetical protein  35 
 
 
111 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.51 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3007  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2484  hypothetical protein  34 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0333285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2284  hypothetical protein  29.52 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.797837  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3631  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.1 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0139  hypothetical protein  26.21 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000532017  hitchhiker  0.000926358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>