21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1820 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1820  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  228  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1846  hypothetical protein  95.45 
 
 
111 aa  217  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2484  hypothetical protein  77.98 
 
 
109 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0333285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2467  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0625027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3647  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0798  hypothetical protein  34.04 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  35.64 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0354  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.59 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496217  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.48 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.136342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3007  hypothetical protein  38 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2566  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.07 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4881  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.56 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968841  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2298  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.74 
 
 
111 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0593  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.76 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.879412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0663  hypothetical protein  31.03 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.78 
 
 
116 aa  43.9  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0705201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1083  hypothetical protein  25 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16763  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3780  hypothetical protein  28 
 
 
124 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>