28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2867 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  217  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1083  hypothetical protein  57.41 
 
 
111 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16763  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2566  hypothetical protein  51.85 
 
 
110 aa  120  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0593  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  63.22 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.879412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2298  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  49.54 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.86 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  36.79 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.18 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0705201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2484  hypothetical protein  33.64 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0333285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1846  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2284  hypothetical protein  32.35 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.797837  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1877  hypothetical protein  35.35 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1904  hypothetical protein  35.35 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4881  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.82 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968841  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.73 
 
 
125 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3814  hypothetical protein  32.69 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0232348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0617  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192438  normal  0.0273387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3631  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0663  hypothetical protein  34.18 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3007  hypothetical protein  30.91 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3647  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2467  hypothetical protein  27.93 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0625027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3709  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.71 
 
 
117 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.71 
 
 
117 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1354  hypothetical protein  34.85 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.04 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.136342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1647  hypothetical protein  45.65 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>