34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3709 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
117 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3709  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
117 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.48 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.44 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.31 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.77 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0705201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.58 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.33 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.36 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3814  hypothetical protein  30.58 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0232348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.5 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  32.71 
 
 
110 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2131  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.97 
 
 
115 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  29.66 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  29.66 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  28.45 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.5 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  34.04 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  28.7 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.7 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.66 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.42 
 
 
118 aa  42  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.5 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.53 
 
 
118 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.84 
 
 
114 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  32.17 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.79 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  26.05 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  29.06 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.5 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.36 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.81 
 
 
147 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>