27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1516 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2467  hypothetical protein  28.18 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0625027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3647  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.18 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2566  hypothetical protein  35.16 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0593  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.879412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.81 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  32.71 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.44 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3709  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.44 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3007  hypothetical protein  32.26 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  26.73 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3631  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.6 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2484  hypothetical protein  28.3 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0333285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2298  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  23.58 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0663  hypothetical protein  30.61 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4881  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.18 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1820  hypothetical protein  30.48 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17380  hypothetical protein  28.69 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3814  hypothetical protein  32.41 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0232348  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1846  hypothetical protein  29.52 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1083  hypothetical protein  23.85 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0354  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.74 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0705201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  28.74 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.66 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1647  hypothetical protein  32.08 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.52 
 
 		 114 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>