28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5842 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5842  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5364  hypothetical protein  66.67 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1716  hypothetical protein  56.36 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2528  hypothetical protein  57.98 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120567  normal  0.11407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0040  hypothetical protein  48.91 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2508  hypothetical protein  48.91 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0653  hypothetical protein  48.91 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2199  hypothetical protein  48.91 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2886  hypothetical protein  48.91 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0816  hypothetical protein  48.91 
 
 		 690 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0529  hypothetical protein  49.68 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0639  hypothetical protein  48.6 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4394  hypothetical protein  47.54 
 
 		 351 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1807  hypothetical protein  46.73 
 
 		 352 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4108  hypothetical protein  46.58 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0619238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3634  hypothetical protein  46.58 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4155  hypothetical protein  46.08 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3306  hypothetical protein  46.08 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4211  hypothetical protein  46.08 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973045  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3793  hypothetical protein  43.35 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00053208  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5839  hypothetical protein  44.52 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1474  hypothetical protein  45.33 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.545512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4122  hypothetical protein  44.22 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0187  hypothetical protein  47.56 
 
 		 323 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6020  hypothetical protein  43.31 
 
 		 320 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5356  hypothetical protein  42.62 
 
 		 327 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0168  hypothetical protein  38.49 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1075  hypothetical protein  35.39 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.752555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>