28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6020 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6020  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3793  hypothetical protein  68.54 
 
 		 320 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00053208  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1474  hypothetical protein  68.32 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.545512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4122  hypothetical protein  69.43 
 
 		 324 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2528  hypothetical protein  45.81 
 
 		 363 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120567  normal  0.11407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1716  hypothetical protein  45.83 
 
 		 360 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0187  hypothetical protein  49.35 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0529  hypothetical protein  45.45 
 
 		 362 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2886  hypothetical protein  45.45 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2508  hypothetical protein  45.45 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0653  hypothetical protein  45.45 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2199  hypothetical protein  45.45 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0040  hypothetical protein  45.45 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0816  hypothetical protein  45.45 
 
 		 690 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0639  hypothetical protein  45.13 
 
 		 362 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4394  hypothetical protein  42.68 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5842  hypothetical protein  43.65 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1807  hypothetical protein  41.67 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3634  hypothetical protein  43.48 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4108  hypothetical protein  43.48 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0619238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4211  hypothetical protein  42.3 
 
 		 351 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973045  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4155  hypothetical protein  42.3 
 
 		 351 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3306  hypothetical protein  42.3 
 
 		 351 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0168  hypothetical protein  42.37 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5364  hypothetical protein  41.99 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1075  hypothetical protein  40.56 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.752555  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5839  hypothetical protein  36.15 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5356  hypothetical protein  36.01 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>