28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3634 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4108  hypothetical protein  99.15 
 
 		 351 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0619238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3306  hypothetical protein  89.46 
 
 		 351 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1807  hypothetical protein  90.91 
 
 		 352 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4155  hypothetical protein  89.46 
 
 		 351 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3634  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4211  hypothetical protein  89.46 
 
 		 351 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973045  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4394  hypothetical protein  85.19 
 
 		 351 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0529  hypothetical protein  70.09 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0040  hypothetical protein  69.97 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2508  hypothetical protein  69.97 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0653  hypothetical protein  69.97 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2199  hypothetical protein  69.97 
 
 		 366 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2886  hypothetical protein  69.97 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0816  hypothetical protein  69.97 
 
 		 690 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0639  hypothetical protein  69.66 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5842  hypothetical protein  46.58 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2528  hypothetical protein  47.56 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120567  normal  0.11407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1716  hypothetical protein  48.06 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5364  hypothetical protein  45.13 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3793  hypothetical protein  42.3 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00053208  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4122  hypothetical protein  41.97 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0187  hypothetical protein  44.93 
 
 		 323 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1474  hypothetical protein  43.2 
 
 		 326 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.545512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6020  hypothetical protein  43.48 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0168  hypothetical protein  42.56 
 
 		 322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5839  hypothetical protein  41.72 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5356  hypothetical protein  36.64 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1075  hypothetical protein  35.37 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.752555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>