28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1716 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2528  hypothetical protein  87.16 
 
 
363 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120567  normal  0.11407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1716  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5842  hypothetical protein  57.65 
 
 
350 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5364  hypothetical protein  57.93 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2199  hypothetical protein  51.42 
 
 
366 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0040  hypothetical protein  51.42 
 
 
362 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2508  hypothetical protein  51.42 
 
 
362 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0653  hypothetical protein  51.42 
 
 
362 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2886  hypothetical protein  51.42 
 
 
362 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0816  hypothetical protein  51.26 
 
 
690 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0529  hypothetical protein  51.41 
 
 
362 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0639  hypothetical protein  51.1 
 
 
362 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4394  hypothetical protein  49.07 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5839  hypothetical protein  49.35 
 
 
327 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3793  hypothetical protein  47.42 
 
 
320 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00053208  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3306  hypothetical protein  48.53 
 
 
351 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4211  hypothetical protein  48.53 
 
 
351 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973045  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4155  hypothetical protein  48.53 
 
 
351 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3634  hypothetical protein  48.06 
 
 
351 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1807  hypothetical protein  47.59 
 
 
352 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4108  hypothetical protein  47.74 
 
 
351 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0619238  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5356  hypothetical protein  46.82 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4122  hypothetical protein  48.09 
 
 
324 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1474  hypothetical protein  47.12 
 
 
326 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.545512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6020  hypothetical protein  45.83 
 
 
320 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0187  hypothetical protein  48.22 
 
 
323 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0168  hypothetical protein  39.24 
 
 
322 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1075  hypothetical protein  34.6 
 
 
323 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.752555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>