28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4122 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4122  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3793  hypothetical protein  91.22 
 
 
320 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00053208  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1474  hypothetical protein  70.62 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.545512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6020  hypothetical protein  69.43 
 
 
320 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1716  hypothetical protein  48.09 
 
 
360 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0187  hypothetical protein  49.67 
 
 
323 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2528  hypothetical protein  45.69 
 
 
363 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120567  normal  0.11407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0529  hypothetical protein  46.28 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2199  hypothetical protein  46.28 
 
 
366 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2886  hypothetical protein  46.28 
 
 
362 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2508  hypothetical protein  46.28 
 
 
362 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0653  hypothetical protein  46.28 
 
 
362 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0040  hypothetical protein  46.28 
 
 
362 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0639  hypothetical protein  45.95 
 
 
362 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0816  hypothetical protein  46.28 
 
 
690 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5842  hypothetical protein  44.75 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4394  hypothetical protein  43.04 
 
 
351 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3634  hypothetical protein  41.97 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4108  hypothetical protein  41.97 
 
 
351 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0619238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1807  hypothetical protein  42.02 
 
 
352 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0168  hypothetical protein  41.19 
 
 
322 aa  238  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4211  hypothetical protein  41.99 
 
 
351 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973045  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4155  hypothetical protein  41.99 
 
 
351 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3306  hypothetical protein  41.99 
 
 
351 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5364  hypothetical protein  43.87 
 
 
344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5839  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1075  hypothetical protein  37.76 
 
 
323 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.752555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5356  hypothetical protein  34.87 
 
 
327 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>