12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1828 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.251935  hitchhiker  0.00387261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2025  anti-FecI sigma factor, FecR  84.81 
 
 		 172 aa  249  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0721  hypothetical protein  48.81 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4598  anti-FecI sigma factor, FecR  51.83 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0325  hypothetical protein  40.65 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  43.55 
 
 		 1237 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1272 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  31.75 
 
 		 378 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3164  hypothetical protein  34.88 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  31.82 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 1198 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  27.21 
 
 		 213 aa  40.8  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>