14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3905 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  68.01 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  66.41 
 
 		 271 aa  358  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  64.5 
 
 		 294 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  63.37 
 
 		 285 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  47.15 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  48.47 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  46.42 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  46.15 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  44.57 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  44.65 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  45.51 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0531  hypothetical protein  42.55 
 
 		 110 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.27 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>