14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1152 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  100 
 
 
294 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  91.2 
 
 
285 aa  512  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  68.23 
 
 
278 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  64.5 
 
 
284 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  62.12 
 
 
271 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  48.38 
 
 
278 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  47.23 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  47.18 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  44.49 
 
 
282 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  44.62 
 
 
288 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  44.16 
 
 
273 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  47.43 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0531  hypothetical protein  44.09 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.07 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>