13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3402 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  73.55 
 
 
278 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  56.34 
 
 
282 aa  299  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  55.07 
 
 
285 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  50.19 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  49.81 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  45.49 
 
 
271 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  46.01 
 
 
278 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  44.65 
 
 
284 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  45.82 
 
 
285 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  44.16 
 
 
294 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  42.77 
 
 
261 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  29.13 
 
 
299 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>