14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1071 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  73.55 
 
 		 273 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  62.95 
 
 		 285 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  57.2 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  52.27 
 
 		 288 aa  282  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  50.94 
 
 		 288 aa  270  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  50.36 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  49.47 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  48.38 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  47.94 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  46.15 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  46.11 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.93 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0531  hypothetical protein  38.3 
 
 		 110 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>