14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1447 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  100 
 
 		 285 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  91.2 
 
 		 294 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  68.73 
 
 		 278 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  63.37 
 
 		 284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  62.88 
 
 		 271 aa  353  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  50.36 
 
 		 278 aa  278  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  49.03 
 
 		 288 aa  261  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  47.21 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  45.62 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  43.82 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  45.82 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  45.71 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0531  hypothetical protein  41.94 
 
 		 110 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>