14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3967 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  62.95 
 
 
278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  58.67 
 
 
282 aa  322  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  54.02 
 
 
288 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  55.07 
 
 
273 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  54.14 
 
 
288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  46.74 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  47.92 
 
 
278 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  44.57 
 
 
284 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  47.18 
 
 
294 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  47.21 
 
 
285 aa  231  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  49.72 
 
 
261 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0531  hypothetical protein  54.17 
 
 
110 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.68 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>