14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1275 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1275  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1001  hypothetical protein  71.22 
 
 
271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3905  prophage antirepressor  68.01 
 
 
284 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1152  prophage antirepressor  68.23 
 
 
294 aa  364  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1447  prophage antirepressor  68.73 
 
 
285 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1527  hypothetical protein  48.51 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.835247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1071  hypothetical protein  49.47 
 
 
278 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0123095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3967  hypothetical protein  47.92 
 
 
285 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0252108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3402  prophage antirepressor  46.01 
 
 
273 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0039  hypothetical protein  43.01 
 
 
282 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0057  hypothetical protein  43.66 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0642  hypothetical protein  47.13 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209985  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0531  hypothetical protein  57.14 
 
 
110 aa  116  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.61 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>