30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3291 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3291  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.527484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3486  hypothetical protein  78.5 
 
 		 108 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3159  hypothetical protein  75.7 
 
 		 108 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4063  hypothetical protein  66.67 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1260  hypothetical protein  64.81 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4218  hypothetical protein  62.86 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.564347  normal  0.125187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1207  hypothetical protein  56.86 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2287  hypothetical protein  36.61 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3879  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0058  putative lipoprotein  44 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0126  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2997  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1540  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3924  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3995  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3063  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3307  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3256  putative lipoprotein  41.56 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3002  putative lipoprotein  41.89 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.227334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0144  hypothetical protein  42.67 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146202  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0147  hypothetical protein  42.67 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2908  hypothetical protein  42.67 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0160  hypothetical protein  42.67 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0134  hypothetical protein  41.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0146  hypothetical protein  41.33 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3326  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1964  putative lipoprotein  40.28 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0941183  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1636  lipoprotein  38.89 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0899246  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1586  lipoprotein  39.19 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1543  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>