28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3879 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3879  putative lipoprotein  100 
 
 
116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0058  putative lipoprotein  93.1 
 
 
116 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0160  hypothetical protein  69.42 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2997  putative lipoprotein  67.23 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0126  putative lipoprotein  67.23 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1540  putative lipoprotein  67.23 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3924  putative lipoprotein  67.23 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0146  hypothetical protein  70.49 
 
 
122 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0134  hypothetical protein  70.49 
 
 
122 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3002  putative lipoprotein  64.1 
 
 
119 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3256  putative lipoprotein  65.55 
 
 
119 aa  146  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3326  hypothetical protein  66.67 
 
 
120 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2908  hypothetical protein  66.94 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0147  hypothetical protein  66.94 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0144  hypothetical protein  64 
 
 
125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146202  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3307  putative lipoprotein  76.83 
 
 
99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3063  putative lipoprotein  76.83 
 
 
99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3995  hypothetical protein  76.83 
 
 
99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1964  putative lipoprotein  44.54 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0941183  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1636  lipoprotein  45.76 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0899246  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1586  lipoprotein  53.4 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3291  hypothetical protein  35.65 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.527484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1207  hypothetical protein  43.42 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3159  hypothetical protein  35.04 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3486  hypothetical protein  35.04 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4063  hypothetical protein  35.51 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4218  hypothetical protein  44.44 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.564347  normal  0.125187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1260  hypothetical protein  34.19 
 
 
109 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>