28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1586 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1586  lipoprotein  100 
 
 		 118 aa  234  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1964  putative lipoprotein  76.8 
 
 		 125 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0941183  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1636  lipoprotein  70.4 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0899246  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3002  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.227334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0160  hypothetical protein  45.9 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2997  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0126  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3924  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1540  putative lipoprotein  50.43 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0146  hypothetical protein  47.15 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0134  hypothetical protein  47.15 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3256  putative lipoprotein  48.72 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3326  hypothetical protein  44.92 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0147  hypothetical protein  46.22 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2908  hypothetical protein  46.22 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3879  putative lipoprotein  54.37 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3307  putative lipoprotein  55.41 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3995  hypothetical protein  55.41 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3063  putative lipoprotein  55.41 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0058  putative lipoprotein  50.49 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0144  hypothetical protein  43.55 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146202  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3159  hypothetical protein  32.46 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3486  hypothetical protein  35.58 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4063  hypothetical protein  33.61 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3291  hypothetical protein  39.44 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.527484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1260  hypothetical protein  30.25 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1207  hypothetical protein  37.31 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4218  hypothetical protein  38.03 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.564347  normal  0.125187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>