28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3002 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_3002  putative lipoprotein  100 
 
 
119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0160  hypothetical protein  59.66 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2997  putative lipoprotein  60.68 
 
 
119 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0126  putative lipoprotein  60.68 
 
 
119 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1540  putative lipoprotein  60.68 
 
 
119 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3924  putative lipoprotein  60.68 
 
 
119 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3256  putative lipoprotein  58.97 
 
 
119 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0146  hypothetical protein  56.67 
 
 
122 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0134  hypothetical protein  56.67 
 
 
122 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0058  putative lipoprotein  62.83 
 
 
116 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3326  hypothetical protein  59.32 
 
 
120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2908  hypothetical protein  58.82 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0147  hypothetical protein  58.82 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3879  putative lipoprotein  61.54 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0144  hypothetical protein  56.1 
 
 
125 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146202  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3307  putative lipoprotein  70.51 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3063  putative lipoprotein  70.51 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3995  hypothetical protein  70.51 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1586  lipoprotein  42.02 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1636  lipoprotein  36 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0899246  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1964  putative lipoprotein  36 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0941183  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1207  hypothetical protein  39.19 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3291  hypothetical protein  41.89 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.527484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4063  hypothetical protein  31.62 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3159  hypothetical protein  29.91 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3486  hypothetical protein  29.06 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4218  hypothetical protein  39.19 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.564347  normal  0.125187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1260  hypothetical protein  29.06 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>