29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1207 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1207  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  222  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3291  hypothetical protein  56.86 
 
 
108 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.527484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3159  hypothetical protein  57.84 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3486  hypothetical protein  57.84 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4218  hypothetical protein  66.67 
 
 
109 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.564347  normal  0.125187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1260  hypothetical protein  50.98 
 
 
109 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4063  hypothetical protein  50.98 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3879  putative lipoprotein  43.42 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0058  putative lipoprotein  42.11 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3002  putative lipoprotein  39.19 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2287  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2997  putative lipoprotein  36.71 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1540  putative lipoprotein  36.71 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3924  putative lipoprotein  36.71 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0126  putative lipoprotein  36.71 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3063  putative lipoprotein  38.16 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3995  hypothetical protein  38.16 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3307  putative lipoprotein  38.16 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3256  putative lipoprotein  35.44 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0144  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146202  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3326  hypothetical protein  34.21 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0146  hypothetical protein  34.21 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0134  hypothetical protein  34.21 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0147  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2908  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0160  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1964  putative lipoprotein  35.53 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0941183  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1636  lipoprotein  34.21 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0899246  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1586  lipoprotein  37.31 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>